核酸纯化柱的选择专题1:质粒提取之---核酸纯纯化柱硅胶膜厚度(层数)选择1;交流咨询QQ:1492876083
最近艾比根实验室通过比较发现不通层数的硅胶膜即不通厚度(本次测试选择艾比根公司厚度为1mm,孔径为0.7um的硅胶膜进行测试,区别市场上0.5mm厚度的硅胶膜,一层相当于市场上的2层厚度),对核酸提取类型有不通的要求,往往存在误区,大多人误以为试剂盒里面的都是选择一样的厚度,然而这样不能最高效的分离核酸,其实不同公司都在选择最优厚度作为分离核酸的纯化柱,以便达到最佳效果。
基因组DNA;RNA,质粒,胶回收,miRNA对膜的厚度要求都是不一样的,本实验室通过专题测试对比。以便广大用户在使用我们的硅胶膜时可以最高效的应用到您的实验,以便提高您检查的灵敏度。本次专题先选取质粒提取作为研究对象,以判断最佳质粒提取用的膜的厚度(本次测试仅测试本公司艾比根销售的硅胶膜)
其他类型的硅胶膜需要你自行研究测试。本次专题:核酸纯化柱的选择专题1:质粒提取之---核酸纯纯化柱硅胶膜厚度(层数)选择。
测试方法:
通过质粒提取试剂盒测试不同厚度条件下的柱子,吸附核酸的浓度和纯度作为判断标准
实验室设计
测试1:选择实际层数为2,3,4,5,6,7,8,9,10层(1mm厚,相当于市场厚度的一倍,市场大多是0.5mm厚膜,比如天根7层厚度加垫片,可自行拆解观察厚度,不同公司选择厚度不一样),洗脱测试浓度
测试2:由于层数增加洗脱会不完全,本次用100微升大体积洗脱,便于对比洗脱完全
测试3:起始浓度的菌液选取2ml测试(不同收集浓度的菌产量有差别)
测试4:选择PUC19质粒作为提取对象。
实验材料
含PUC19质粒DH5A菌株,分光光度计
实验方法
按照艾比根质粒小量提取试剂盒提取过夜培养的菌液,测定浓度 。
实验结果数据分析
PUC19质粒提取原始测量浓度数据:
膜层数 |
货号 |
编号 |
类型 |
SW (nm) |
SW Abs |
260Abs 10mm |
280Abs 10mm |
260/280 |
260/230 |
Conc. (Ng/ul) |
2层 |
P2-50/500/5000 |
40 |
dsDNA |
260 |
1.661 |
1.661 |
0.777 |
2.14 |
2.18 |
83.1 |
3层 |
P3-50/500/5000 |
41 |
dsDNA |
260 |
1.679 |
1.679 |
0.782 |
2.15 |
2.25 |
84 |
4层 |
P4-50/500/5000 |
43 |
dsDNA |
260 |
2.035 |
2.035 |
0.954 |
2.13 |
2.23 |
101.7 |
5层 |
P5-50/500/5000 |
44 |
dsDNA |
260 |
2.442 |
2.442 |
1.152 |
2.12 |
2.2 |
122.1 |
6层 |
P6-50/500/5000 |
45 |
dsDNA |
260 |
2.734 |
2.734 |
1.259 |
2.17 |
2.29 |
136.7 |
7层 |
P7-50/500/5000 |
46 |
dsDNA |
260 |
3.092 |
3.092 |
1.435 |
2.15 |
2.27 |
154.6 |
8层 |
P8-50/500/5000 |
47 |
dsDNA |
260 |
3.128 |
3.128 |
1.497 |
2.09 |
2.25 |
156.4 |
9层 |
P9-50/500/5000 |
48 |
dsDNA |
260 |
3.551 |
3.551 |
1.643 |
2.16 |
2.3 |
177.6 |
10层 |
P1-50/500/5000 |
49 |
dsDNA |
260 |
3.119 |
3.119 |
1.448 |
2.15 |
2.31 |
155.9 |
实验趋势图
说明:本数据仅为艾比根实验室测试,仅供你选择产品时候的参考,不作为你最终产品的使用依据,针对您的配方请自行设计方案测试您的最佳使用条件。
分光光度计测量图
结论:
质粒提取选择要点
-
对于需要50ul洗脱体积的建议选择P2-P5厚度的膜,优选P5
-
对于洗脱体积大于50建议选择p6-10的膜,优选 p7
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其它厚度的刻自行研究测试
-
不同菌液和质粒提取含量有所差别,具体选择生产企业可自行测试
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说明:本次实验仅供参考,只是本实验室实验员操作测试对比数据,不同使用环境请自行研究测试。